Події Killing Floor 2 розгортаються через місяць після подій першої частини. Гравці можуть зібрати команду з шести чоловік, щоб зупинити вторгнення зомбі. Події розгортаються в континентальній Європі, де епідемія хвороби, спричинена невдалим експериментом Horzine Biotech, поширюється швидко та в неймовірних масштабах, паралізуючи Європейський Союз. Модельні клони заполонили все, і цивілізація впала в кризу. Комунікації перерізані, національні уряди зазнають поразки, а військові сили систематично знищуються. Жителі Європи дуже добре знають, що означає виживання, і ті, кому пощастило вижити, йдуть у підпілля.
Але ще не всі втратили надію.... Група найманців і цивільних осіб об’єдналися для боротьби з мутантами, створюючи бази по всій Європі. Після епідемій гравці відвідають гарячі точки, заражені зедами, і повинні будуть їх знищити.
У грі є новий режим PvP, розрахований на дванадцять осіб. Гравці діляться на дві команди: перша гра за людей, що вижили, а друга - за ожилих мертвих.
