Події Metal Gear Solid V: The Phantom Pain відбуваються в 1984 році. Прокинувшись від коми, головний герой Снейк намагається створити нову армію найманців, щоб замінити ту, яку він втратив у Ground Zeroes, і помститися тим, хто відповідальний за його падіння, для цього він бере участь у таємних операціях в Афганістані під час радянсько-афганської війни та на кордоні Анголи та Заїру під час війни. Громадянська війна в Анголі.
Як і в попередніх іграх Metal Gear, у The Phantom Pain гравець повинен рухатися непомітно та уникати зіткнень з ворогами, наприклад непомітно проникаючи на військові бази; Однак це перша гра в серії з відкритим світом - гравець може вільно переміщатися по величезній карті, вибираючи власні завдання, час і способи їх виконання.